История издания ведется с альманаха «Томская старина», в котором публиковался взгляд современников на историю бывшей Томской губернии. Первоначально издание являлось приложением к газете «Сибирские Афины». Со второй половины 1992 года издание преобразовано в краеведческий альманах «Сибирская старина». Горизонты расширяются — уже не только Томск и территории, входившие в состав бывшей Томской губернии, становятся объектом внимания альманаха, а вся Сибирь — от Урала до Тихого океана.